「御上先生」は、日本の教育を変えようという思いを持つ文科省官僚の御上孝（松坂さん）が、私立高校「隣徳学院」への出向を命じられる。実質、左遷人事だったが、御上は自ら教壇に立ち、令和の時代を生きる18歳の高校生を導きながら、権力に立ち向かっていく……という“大逆転教育再生ストーリー”。